اصولا فرایند قانونگذاری در مجلس شورای اسلامی با ارائه لوایح از طریق دولت و طرح‌ها از طریق مجلس و بررسی آنها درکمیسیون مرتبط انجام می‌گیرد، نقش کمیسیون‌ها در هر دو مورد، چه لوایح و چه طرح‌ها بسیار اساسی و تعیین‌کننده است. بررسی جایگاه سازمان محیط‌زیست در ساختار مجلس شورای اسلامی نشان می‌دهد که همواره محیط‌زیست به‌عنوان موضوعی فرعی در کنار موضوعات اصلی جایگاه مناسب و مستقلی نداشته است. در مجلس اول و دوم کمیسیون مستقلی وجود داشت تحت عنوان کمیسیون سازمان‌های تابع نخست‌وزیری که دربرگیرنده سازمان‌های محیط‌زیست، اوقاف، تربیت‌بدنی و انرژی اتمی بود و بسیار فعال و پویا مسائل و برنامه‌های محیط‌زیست را مورد توجه قرار می‌داد اما با تغییراتی که در امور داخلی مجلس صورت پذیرفت این کمیسیون حذف و برنامه‌های بخش محیط‌زیست و سازمان مربوطه عملا زیرنظر کمیسیون آب، کشاورزی و منابع طبیعی قرار گرفت. این درحالی است که بخش‌های آب و کشاورزی خود با انبوهی از مسائل و مشکلات مواجه بوده و هستند و طرح موضوعات محیط‌زیست به‌صورت ریشه‌ای در اولویت بعدی این کمیسیون است. از سوی دیگر بخش کشاورزی به‌عنوان بخش تولیدی، اقتصادی و اشتغال‌زا نقش بسیار مهمی در کشور دارد و این بخش باتوجه به لزوم بهره‌برداری از منابع زیستی مختلف از قبیل آب، خاک، جنگل و مرتع، با محیط‌زیست در تضاد است.

البته باید اشاره کنم که بی‌توجهی به جایگاه محیط‌زیست در مجلس امر دوجانبه بوده و هست، به‌طوری که سایر وزارتخانه‌ها و دستگاه‌ها ارتباط تنگاتنگی با قوه قانونگذاری داشته و به دلیل پیشگیری از سؤال و استیضاح وزیر، سعی در برقراری تعاملات فعال و بیشتر با مجلس می‌کنند. اما در سازمان محیط‌زیست این امر تحقق پیدا نمی‌کند و در برهه‌های مختلف ارتباط سازمان با مجلس محدود و حتی به سطح کارشناسی می‌رسد که نتیجه آن برای سازمان بسیار زیانبار است. مطمئنا تشکیل یک کمیسیون ویژه محیط‌زیست و منابع طبیعی درساختار قوه‌مقننه ضروری است چون مسائل و موضوعات محیط‌زیست به همان اندازه و شاید بیشتر از کمیسیون‌هایی نظیر صنعت، انرژی، عمران و... وجود دارد. وجود چنین کمیسیونی در 2 بخش دیگر یعنی تصویب و تخصیص اعتبارات و برنامه‌ها نیز می‌تواند بسیار تأثیرگذار و تا حد قابل توجهی محیط‌زیست رنجور کشور را یاری کرده و از بحران‌های فرارو نجات دهد. ابلاغ سیاست‌های کلی محیط‌زیست توسط مقام معظم رهبری و لزوم پیگیری آنها توسط قوای سه‌گانه، امیدها را برای تحقق این آرزو زنده ساخته است.